It has become standard to use gradient-based dimensionality reduction (DR) methods like tSNE and UMAP when explaining what AI models have learned. This makes sense: these methods are fast, robust, and have an uncanny ability to find semantic patterns in high-dimensional data without supervision. Despite this, gradient-based DR methods lack the most important quality that an explainability method should possess: themselves being explainable. That is, given a UMAP output, it is currently unclear what one can say about the corresponding input. We work towards closing this question by relating UMAP to classical DR techniques. Specifically, we show that one can fully recover methods like PCA, MDS, and ISOMAP in the modern DR paradigm: by applying attractions and repulsions onto a randomly initialized dataset. We also show that, with a small change, Locally Linear Embeddings (LLE) can indistinguishably reproduce UMAP outputs. This implies that the UMAP effective objective is minimized by this modified version of LLE (and vice versa). Given this, we discuss what must be true of UMAP emebddings and present avenues for future work.


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Locally linear embedding(LLE) 是一种非线性降维算法,它能够使降维后的数据较好地保持原有流形结构。LLE可以说是流形学习方法最经典的工作之一。很多后续的流形学习、降维方法都与LLE有密切联系。
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