Software-defined wide area network (SD-WAN) has emerged as a new paradigm for steering a large-scale network flexibly by adopting distributed software-defined network (SDN) controllers. The key to building a logically centralized but physically distributed control-plane is running diverse cluster management protocols to achieve consistency through an exchange of control traffic. Meanwhile, we observe that the control traffic exposes unique time-series patterns and directional relationships due to the operational structure even though the traffic is encrypted, and this pattern can disclose confidential information such as control-plane topology and protocol dependencies, which can be exploited for severe attacks. With this insight, we propose a new SD-WAN fingerprinting system, called Heimdallr. It analyzes periodical and operational patterns of SD-WAN cluster management protocols and the context of flow directions from the collected control traffic utilizing a deep learning-based approach, so that it can classify the cluster management protocols automatically from miscellaneous control traffic datasets. Our evaluation, which is performed in a realistic SD-WAN environment consisting of geographically distant three campus networks and one enterprise network shows that Heimdallr can classify SD-WAN control traffic with $\geq$ 93%, identify individual protocols with $\geq$ 80% macro F-1 scores, and finally can infer control-plane topology with $\geq$ 70% similarity.


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