Local maxima and minima, or extremal events, in experimental time series can be used as a coarse summary to characterize data. However, the discrete sampling in recording experimental measurements suggests uncertainty on the true timing of extrema during the experiment. This in turn gives uncertainty in the timing order of extrema within the time series. Motivated by applications in genomic time series and biological network analysis, we construct a weighted directed acyclic graph (DAG) called an extremal event DAG using techniques from persistent homology that is robust to measurement noise. Furthermore, we define a distance between extremal event DAGs based on the edit distance between strings. We prove several properties including local stability for the extremal event DAG distance with respect to pairwise $L_{\infty}$ distances between functions in the time series data. Lastly, we provide algorithms, publicly free software, and implementations on extremal event DAG construction and comparison.


翻译:实验时间序列中的本地最大值和微型值,或极端值事件,可以用作粗略的概括性数据特征。然而,在记录实验测量中的离散抽样表明实验期间的极限值真实时间的不确定性。这反过来又给时间序列中的极限值的时间顺序带来不确定性。我们利用基因时间序列和生物网络分析的应用,建造了一个加权定向循环图(DAG),它使用从持久性同系物学到测量噪音的可靠技术,称为极端值事件DAG。此外,我们根据字符串之间的编辑距离界定了极端值事件DAG之间的距离。我们证明了若干特性,包括极端事件DAG距离对时间序列数据中函数之间距离的本地稳定性。最后,我们提供了算法、公开免费软件和对极端值事件DAG的构建和比较实施。

0
下载
关闭预览

相关内容

不可错过!700+ppt《因果推理》课程!杜克大学Fan Li教程
专知会员服务
72+阅读 · 2022年7月11日
专知会员服务
51+阅读 · 2020年12月14日
ACM MM 2022 Call for Papers
CCF多媒体专委会
5+阅读 · 2022年3月29日
AIART 2022 Call for Papers
CCF多媒体专委会
1+阅读 · 2022年2月13日
【ICIG2021】Latest News & Announcements of the Industry Talk1
中国图象图形学学会CSIG
0+阅读 · 2021年7月28日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
43+阅读 · 2019年1月3日
国家自然科学基金
5+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
Arxiv
0+阅读 · 2022年9月30日
VIP会员
相关资讯
ACM MM 2022 Call for Papers
CCF多媒体专委会
5+阅读 · 2022年3月29日
AIART 2022 Call for Papers
CCF多媒体专委会
1+阅读 · 2022年2月13日
【ICIG2021】Latest News & Announcements of the Industry Talk1
中国图象图形学学会CSIG
0+阅读 · 2021年7月28日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
43+阅读 · 2019年1月3日
相关基金
国家自然科学基金
5+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员